"The secreted protein discovery initiative (SPDI), a large-scale effort to identify novel human secreted and transmembrane proteins: a bioinformatics assessment."
Clark H.F. , Gurney A.L. , Abaya E. , Baker K. , Baldwin D.T. , Brush J. , Chen J. , Chow B. , Chui C. , Crowley C. , Currell B. , Deuel B. , Dowd P. , Eaton D. , Foster J.S. , Grimaldi C. , Gu Q. , Hass P.E. , Heldens S. , Huang A. , Kim H.S. , Klimowski L. , Jin Y. , Johnson S. , Lee J. , Lewis L. , Liao D. , Mark M.R. , Robbie E. , Sanchez C. , Schoenfeld J. , Seshagiri S. , Simmons L. , Singh J. , Smith V. , Stinson J. , Vagts A. , Vandlen R.L. , Watanabe C. , Wieand D. , Woods K. , Xie M.-H. , Yansura D.G. , Yi S. , Yu G. , Yuan J. , Zhang M. , Zhang Z. , Goddard A.D. , Wood W.I. , Godowski P.J. , Gray A.M. more...
Genome Res.13:2265-2270(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

"Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs."
Ota T. , Suzuki Y. , Nishikawa T. , Otsuki T. , Sugiyama T. , Irie R. , Wakamatsu A. , Hayashi K. , Sato H. , Nagai K. , Kimura K. , Makita H. , Sekine M. , Obayashi M. , Nishi T. , Shibahara T. , Tanaka T. , Ishii S. , Yamamoto J. , Saito K. , Kawai Y. , Isono Y. , Nakamura Y. , Nagahari K. , Murakami K. , Yasuda T. , Iwayanagi T. , Wagatsuma M. , Shiratori A. , Sudo H. , Hosoiri T. , Kaku Y. , Kodaira H. , Kondo H. , Sugawara M. , Takahashi M. , Kanda K. , Yokoi T. , Furuya T. , Kikkawa E. , Omura Y. , Abe K. , Kamihara K. , Katsuta N. , Sato K. , Tanikawa M. , Yamazaki M. , Ninomiya K. , Ishibashi T. , Yamashita H. , Murakawa K. , Fujimori K. , Tanai H. , Kimata M. , Watanabe M. , Hiraoka S. , Chiba Y. , Ishida S. , Ono Y. , Takiguchi S. , Watanabe S. , Yosida M. , Hotuta T. , Kusano J. , Kanehori K. , Takahashi-Fujii A. , Hara H. , Tanase T.-O. , Nomura Y. , Togiya S. , Komai F. , Hara R. , Takeuchi K. , Arita M. , Imose N. , Musashino K. , Yuuki H. , Oshima A. , Sasaki N. , Aotsuka S. , Yoshikawa Y. , Matsunawa H. , Ichihara T. , Shiohata N. , Sano S. , Moriya S. , Momiyama H. , Satoh N. , Takami S. , Terashima Y. , Suzuki O. , Nakagawa S. , Senoh A. , Mizoguchi H. , Goto Y. , Shimizu F. , Wakebe H. , Hishigaki H. , Watanabe T. , Sugiyama A. , Takemoto M. , Kawakami B. , Yamazaki M. , Watanabe K. , Kumagai A. , Itakura S. , Fukuzumi Y. , Fujimori Y. , Komiyama M. , Tashiro H. , Tanigami A. , Fujiwara T. , Ono T. , Yamada K. , Fujii Y. , Ozaki K. , Hirao M. , Ohmori Y. , Kawabata A. , Hikiji T. , Kobatake N. , Inagaki H. , Ikema Y. , Okamoto S. , Okitani R. , Kawakami T. , Noguchi S. , Itoh T. , Shigeta K. , Senba T. , Matsumura K. , Nakajima Y. , Mizuno T. , Morinaga M. , Sasaki M. , Togashi T. , Oyama M. , Hata H. , Watanabe M. , Komatsu T. , Mizushima-Sugano J. , Satoh T. , Shirai Y. , Takahashi Y. , Nakagawa K. , Okumura K. , Nagase T. , Nomura N. , Kikuchi H. , Masuho Y. , Yamashita R. , Nakai K. , Yada T. , Nakamura Y. , Ohara O. , Isogai T. , Sugano S. more...
Nat. Genet.36:40-45(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

"Human chromosome 11 DNA sequence and analysis including novel gene identification."
Taylor T.D. , Noguchi H. , Totoki Y. , Toyoda A. , Kuroki Y. , Dewar K. , Lloyd C. , Itoh T. , Takeda T. , Kim D.-W. , She X. , Barlow K.F. , Bloom T. , Bruford E. , Chang J.L. , Cuomo C.A. , Eichler E. , FitzGerald M.G. , Jaffe D.B. , LaButti K. , Nicol R. , Park H.-S. , Seaman C. , Sougnez C. , Yang X. , Zimmer A.R. , Zody M.C. , Birren B.W. , Nusbaum C. , Fujiyama A. , Hattori M. , Rogers J. , Lander E.S. , Sakaki Y. more...
Nature440:497-500(2006) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

Mural R.J. , Istrail S. , Sutton G. , Florea L. , Halpern A.L. , Mobarry C.M. , Lippert R. , Walenz B. , Shatkay H. , Dew I. , Miller J.R. , Flanigan M.J. , Edwards N.J. , Bolanos R. , Fasulo D. , Halldorsson B.V. , Hannenhalli S. , Turner R. , Yooseph S. , Lu F. , Nusskern D.R. , Shue B.C. , Zheng X.H. , Zhong F. , Delcher A.L. , Huson D.H. , Kravitz S.A. , Mouchard L. , Reinert K. , Remington K.A. , Clark A.G. , Waterman M.S. , Eichler E.E. , Adams M.D. , Hunkapiller M.W. , Myers E.W. , Venter J.C. more...
Submitted (2005-07) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases

"The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)."
The MGC Project Team
Genome Res.14:2121-2127(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

"Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites."
Zhang Z. , Henzel W.J.
Protein Sci.13:2819-2824(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]